在哈利波特：魔法觉醒的魔法世界里，除了主线课程和决斗俱乐部，游戏还铺设了大量需要玩家自行探索的隐藏内容，这些构成了游戏深度体验的重要部分。隐藏成就便是其中之一，它们不会在成就系统中直接列出，只有达成特定条件后才会解锁。夜游之神需要你饮用隐身药水后，在夜间造访霍格沃茨的四个学院公共休息室以及校长室；无期徒刑则要求在玩家对玩家（PVP）的决斗中累计使用阿瓦达索命咒命中敌人300次，颇具挑战性。此外还有考验运气的福灵再现，目标是在一次图书馆抽卡中同时获得三张金卡，反之，连续五次触发图书馆保底机制则会解锁名为不幸成真的成就。对于喜欢挑战单人玩法的玩家，自强不息成就等待着那些能够单人通关五星及以上难度的紫色禁林的勇士。完成这些隐藏成就能获得包括非凡卡包、独特头像框在内的丰厚奖励。
游戏的各个角落还散布着许多有趣的隐藏彩蛋，等待细心的巫师去发现和互动。这些彩蛋往往与原著细节或趣味玩法结合，触发后能获得小额资源或特别的视觉体验。点击寝室窗户上的特定光点，可以观看一段学院巡游动画并能分享获取钻石；在图书馆通过特定方式退出，有时会意外进入铺满巧克力蛙盒子的有求必应屋。一些卡牌立绘也藏着互动惊喜，多次点击马尔福三人组伙伴卡，克拉布和高尔的形象会发生变化，暗示他们是由哈利和罗恩假扮的经典剧情。在城堡外，禁林边缘的打人柳可以被挑战，成功击败它能获得一幅增加幸运值的画像；而携带豪华礼盒赠送的嗅嗅前往城堡外指定地点，它还会挖出金币供你拾取。
更具探索深度的隐藏内容则与特定的游戏玩法绑定。无名之书副本中包含了需要达成特殊条件才能完成的隐藏挑战，例如在密室章节中选择扔掉毒牙并与汤姆·里德尔搏斗，在囚徒章节中则需要利用特定咒语控制节奏。而在充满未知的禁林探索中，使用高星级的蓝色、紫色或红色线索时，有几率触发独特的隐藏任务，例如寻犬启事任务就需要玩家在探索中选择正确的分支路线，调查特定事件，最终引发与三头犬的Boss战。这类隐藏任务不仅奖励丰厚，其剧情和战斗机制也往往设计得别具一格，对玩家的卡组搭配和战术选择提出了更高要求。
